(*)实验平台与试剂要求
采用*** ********官方最新*****技术平台(******** **********、******** */**)及*** ********原厂原装***** ********* *' **** ********** **试剂盒开展单细胞捕获标记。供应商须具备*** ********单细胞转录组实验平台和******** ******* * ****测序能力,能够独立完成单细胞转录组测序及数据分析工作。
(*)细胞悬液制备与质检要求
对样本组织进行细胞解离制备单细胞悬液,使用********* **智能细胞分析仪对单细胞悬液进行质检与准确计数,每个测序样本需满足:细胞活性≥**%,结团率≤*%,细胞浓度范围为*************/μ*,细胞直径<**μ*,有核率≥**%。
(*)****制备与质检要求
构建**** (*** **** ** ********)完成单细胞分离和标签化,对****破油处理后,采用磁珠纯化富集一链****并完成****扩增与质检。片段分布检测采用安捷伦****、安捷伦****等设备,文库浓度检测采用*****、****等方法;需满足主峰****浓度≥*.***/**,片段大小主峰位置在*******之间。
(*)测序文库质量要求
****质检合格后构建二代测序文库,需满足:文库浓度≥***/**,体积≥****,接头污染占比<**%,主峰片段大小在*********之间;文库插入片段检测为单峰,分布均匀,呈标准正态分布。
(*)测序参数要求
使用******** ******* * ****高通量平台完成测序,测序模式为*****;每个检测样本的总数据量不低于**** *** ****。
(*)生物信息分析要求
供应商需具备数据分析团队与服务器集群分析平台,提供专属高级单细胞转录组云分析流程,交互分析(不含云工具)需覆盖以下内容(提供云平台的相关截图):
①基础分析:包含测序数据统计****报告、细胞质量过滤与评估(过滤范围含线粒体、核糖体、红细胞(仅限动物样本)、双细胞等);
②标准分析*:降维与聚类分析,至少包含****、****可视化结果;
③标准分析*:细胞类型注释(线上至少包含*种注释方式,包含自建细胞类型******基因数据库、*种注释软件)、细胞类群差异分析,至少包含火山图、**图;
④标准分析*:针对筛选的细胞类型开展亚群细分、功能注释、基因集分析;其中功能注释至少覆盖**、****、**、******、**********、****、********、**和********共*大数据库;基因集分析包含功能富集分析、聚类分析、****分析、****富集分析等;
⑤个性化分析:提供≥**项个性化分析,至少包含********拟时序分析、细胞通讯分析、*******分析、******转录因子分析、***速率分析、单细胞代谢分析、单细胞******分析、恶性细胞***分析、单细胞反卷积分析;同时提供单细胞转录组云平台交互式报告拓展工具,满足更多个性化分析需求。
(*)云平台要求
①云平台拥有完善的资料体系,综述、***、文献案例解析、视频教程、分析****五位一体。
②云平台可在线自主设置参数进行动态交互分析,灵活选择参数、计算方法、检验方法,自主上传临床因子。
③云平台具备个性化呈图方案:可进行项目中所有分析绘图的配色方案及字体一键化修改,个性化展示数据呈图结果。
④云平台提供辅助数据全方位分析的小工具,小工具≥***款。
(*)科研能力
****年至今合作客户文章不少于*****篇。提供以供应商名称为检索关键词,分别在****、********
**********、*************官方平台检索所得的网页截图。