单细胞转录组测序项目
2026-09-20
山东/济南 中标结果
单细胞转录组测序项目
山东/济南-2026-09-20 00:00:00
山东/济南-2026-09-20 00:00:00
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发布时间:********** **:**:** 截止时间:********** **:**:**
基本信息:
采购明细:
序号 | 项目名称 | 数量/单位 | 预算价 | 项目内容 | 质保及售后服务 | 附件 |
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单细胞转录组测序项目
| *(批) | ****** |
一、产品规格与技术参数指标
本服务共计包含**个独立组织样本的全流程实验、建库、上机测序及标准生信挖掘。中标方须严格满足以下各项高精度硬性指标:
*.* 前期组织处理、单细胞悬液制备质控指标
单细胞悬液制备:负责对采购方提供的组织样本进行温和解离及单细胞悬液制备。解离过程必须严格控制酶活、消化时间及重悬流速,镜检严禁含有细胞团块、死细胞碎片、红细胞污染或非细胞组织杂质。
细胞活率与浓度硬性指标:细胞上机起始浓度必须通过高精度复核,严格控制在******** *****/μ*。解离后的单细胞悬液,细胞活性硬性要求≥**%。
*.* ***单细胞文库构建与高通量测序参数
微流控油滴包裹捕获:必须基于*** ******** ******** 系统进行细胞捕获。利用带有**** **** *******、**** *** 及 **** ****(**) 序列标签的胶珠(*****)和单个细胞高效包裹在“油包水”液滴中,形成****** **** ****结构。
物理通道独立性:本项目共**个独立样本,必须占用**个完全独立的***芯片物理通道(*****)进行包裹,严禁为了拼单或节省成本进行任何形式的多样本*******混样混测。
细胞回收与双细胞率控制:最终经生信过滤、*************(版本:*.*.*)算法识别并精准剔除双细胞(******* *****)后,单样本回收的高质量有效细胞数(********* ****** ** *****)必须稳定在**,***个细胞左右(验收合格底线为≥**,***个细胞,严格对齐官方质控表标准)。
下机数据量与测序质量:
采用********/******等超高通量测序仪进行双端*****测序策略。
单样本下机有效测序数据量必须严格≥****(即单样本有效测序*****数≥*** *单端*****/*** *对** *****)。全项目**个样本总下机有效数据量必须严格≥**,****(***亿条)*****,总*** ****不低于*.* **,数据缺口严禁超过 *.*%。
测序质量分值(*****)必须严格符合:******************** ≥ **.*%,********************* ≥**%,**************** ≥ **%。
二、 数据分析与技术交付标准
中标方交付的数据分析报告及原始文件,必须完全涵盖标准生信流程:
*.原始数据质控与比对:使用******和******软件对每个样本的原始数据进行严格的数据量与碱基质量统计。利用官方**** ******软件进行*******矫正比对及基因表达定量,生成高保真细胞*基因表达矩阵。
*.高级单细胞生信过滤:单细胞***数目阈值严格卡死在大于***且小于**,***;单个细胞检测到的****数目阈值卡死在大于***且小于*,***;线粒体基因比例(*******.****)过滤阈值必须严格小于**%,以精准剔除低质量的死亡或空泡细胞。
*.数据整合、降维与分群:通过*包******(版本:*.*.*)对数据进行标准化与*****处理。多样本间采用***+***方法或 *******(版本:*.*.*)包进行多样本整合与批次矫正。利用高变基因进行高级主成分分析(***)降维,基于***********聚类算法进行细胞群划分,最终利用*****和****二维流形图形对单细胞降维结果进行高清聚类展示。
*.特异性标记基因(******)鉴定:利用********秩和检验(************** 函数)将各细胞群分别与其他所有细胞群进行差异分析。差异基因筛选硬性指标为:******.********* ***; *,且**********校正后的显著性优势指标********* ***; *.**。通过聚类热图、气泡图、分群质量指标小提琴图进行可视化呈现。
*.功能通路富集与自动注释:利用超几何检验进行高级 **(**** ********)三大分支功能富集分析及**** *******信号通路富集分析,筛选*.****** ***; *.** 的显性条目产出*******图及*******通路结构图。单细胞分群必须采用*******(版本:*.*.*)软件对比官方参考数据库进行全自动、高可信度的细胞类型标签注释。
*.产权归属:本项目服务期内产生的所有表达矩阵(***)、***格式聚类文件、下机文库及生信工作流成果,知识产权完全归采购方(甲方)所有,中标方不得用于公开发表或其他任何商业、非商业用途。
三、售后服务
*. 无损复测与全额试剂赔偿条款:因原代组织解离后的活细胞样品具有极其珍稀且不可逆的孤品性质,在细胞解离、微流控捕获、油滴包裹、逆转录文库构建或者上机测序全流程中,若因中标方操作延迟、重悬加样手法不当导致芯片堵孔、油滴破乳、最终回收的高质量有效细胞数未达**,***±***个,或下机测序数据量及***质量不达标(如******* ***跌破**.*%),中标方必须无条件免费提供同等规格的全新原厂芯片、***捕获耗材盒及测序试剂重新进行实验,由此产生的所有连带试剂与芯片成本由中标方全额承担。
*. 包干结算保障。该费用已包含**个样本从单细胞制备、微流控芯片捕获、双端文库构建、上机测序(总计**.* ******* *****通量谱)到**** ******表达矩阵及*******注释全套生信分析交付的所有芯片、试剂、人工及机器算力成本。中标后不得以任何理由要求采购方追加任何额外费用。
*. 交付时效性:本项目时间紧迫,为保障项目敏捷推进,自提交合格组织样品起计算,标准常规测序数据及质控结果须在*个工作日内交付。
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(*) 本项目服务期为*年。(*) 质量保证期为*年。
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