*、***基因组常染色体组装 利用******** ************测序平台完成后的***超长*****进行******组装。质量要求：基因组无***，中部着丝粒、亚中部着丝粒、亚端部着丝粒染色体*端端粒完整，着丝粒无缺失且端着丝粒（*****、*****、*****、*****、*****、*****）的染色体组装完整，基因组**值达到***及以上。 *、***基因组*染色体组装 利用*********平台测序的亲本、子代二代*****和子代******** ************平台测序的***超长*****进行分型组装。质量要求：*染色体长度至少***，*染色体着丝粒完整，*端端粒完整，*染色体*****覆盖均匀。 *、基因组注释 利用******** *******平台测序出来的*个二代转录组及*个三代全长转录组和近源种的蛋白进行注释。质量要求：蛋白编码基因数量*万左右，重复序列注释含量**%左右，平均基因长度***左右。 *、比较基因组分析 共线性分析：与近缘物种进行共线性(************)比较，绘制共线性比较图，解析基因组结构差异(如染色体重排、倒位、易位)。 进化与变异分析：进行基因家族聚类、系统发育树构建、物种分化时间推算、基因家族收缩/扩张分析、**/**偏倚分析。 *、其他 其他未尽事项均在合同中约定，并在沟通中适度调整。