样本数量*个，鹅回肠末端，服务内容包括单细胞转录组测序以及后续分析服务。 *.单细胞**×平台组学技术参数 原始数据质控预处理软件：*** ********官方软件**** ******；基因比对软件：**** （******* *********** ********* ** * *********）；基因定量后质控数据标准化处理包：******；拥有自主研发的分析云平台，可供用户自主进行分析  *.单细胞**×平台分析内容 测序数据质量评估：根据上述技术参数将比对到参考基因组的结果用于计算每个样品相关测序数据质量，并提供测序数据质量及各样本细胞质量的相关统计信息；   基因定量质控：在 **** ****** 初步质控的基础上进一步对实验数据进行质控，剔除多细胞、双细胞或者未结合上细胞的数据，进行下游分析；   去除批次效应（可选）：采用互享最近邻(***) 方法去除批次效应，从而保证样本中的异质性均来自于实验设计或者细胞类型的差异；   降维聚类和可视化：单细胞转录组常用的降维算法为 ***（********* ********** ********, 主成分分析）和****或**** 算法。基于 *** 的降维结果通过 ****或**** 对单细胞群聚类进行可视化，聚类算法采用***，最终获得最优细胞分群；   ****** 基因鉴定与可视化：使用 ****** 检验方法对指定细胞群与其余所有细胞群进行差异检验，筛选的条件为：*****.********* 大于 *, ***.***（基因在所有细胞中的表达占比）大于 *.**，从而得到每个细胞群所有的 ****** 基因；   细胞类型鉴定：主流的细胞类型鉴定方法有两种：一是通过 *******包基于单细胞参考表达谱数据集进行细胞类型注释；二是欧易技术将基于文献报道的对应组织中各细胞类型经典******基因，提供人工细胞类型注释服务；   差异基因表达分析：使用******包的***********函数进行差异表达基因筛选，默认使用 ****** 差异检验方法。进一步根据差异倍数（**********）及显著性检验（******）筛选显著的差异表达基因；   差异基因功能分析：利用**/****数据库对差异蛋白编码基因进行功能注释，并用超几何分布检验的方法计算每个 ******* 条目中差异基因富集的显著性；   基因集富集分析：常见的有两种，****(**** *** ********** ********，****)基因集富集分析，常用于有预定义的基因集(通常来自功能注释或先前实验的结果)情况下，基于****分析判断此基因集内基因的协同变化对表型变化的影响。****(**** *** ********* ********, ) 基因集变异分析，主要通过将基因在不同样品/不同细胞群间的表达量矩阵转化成基因集在样品/ 细胞群间的表达量矩阵，用于评估不同的通路在不同样品间/不同细胞群间的富集程度。   细胞亚群鉴定：根据先前细胞聚类的结果，从中挑选感兴趣的特定细胞群进行亚群细分；   拟时序分析：针对重点关注的细胞类型进行拟时序分析，通过*******软件进行轨迹分析，探索细胞分化轨迹，描绘在细胞分化过程中基因表达的变化规律，揭示与疾病发展或者个体发育相关的关键基因；   细胞间通讯：基于***************数据库，根据不同细胞膜表面和游离的蛋白之间的 ***************关系鉴定不同细胞之间可能的相互作用，这种作用包括自分泌和旁分泌。使用***********或********软件包以细胞亚群的基因表达量数据为研究对象，获取细胞中的配体及受体信息，获得细胞间的信号通讯关系，以阐明在广泛的生物学过程中细胞间通讯的复杂性、多样性和动态性。   转录因子调控网络：采用******分析转录组调控子及其靶基因的关系，找出的关键*******中的靶基因可与前期挖掘到的差异基因进行联合分析，探索关键**是否参与调控差异基因的变化，另一方面，通过比较不同细胞群或同一细胞群在不同分组中与各调控关系活跃性的强弱差异，确定与目标细胞群特异相关的调控网络。在寻找到关键靶基因后可利用细胞实验或者基因敲除等技术进行验证。   其他个性化分析：应用*** ******** 分析，采用 ******** 算法，通过计算细胞内 **** 剪接前后比例来估计 *** 丰度随时间的变化，推断细胞的下一个可能的分化方向。应用********分析，采用几种******** **********过滤方法减少数据中噪声信号，从而发现真正的拷贝数变异信号，并预测 *** 区域，推断肿瘤单细胞转录组数据中体细胞染色体大片段变异情况。

提供*年后续分析服务，工程师上门提供现场组织解离与质检服务，对于质检不合格的组织样品提供两次免费的重新上门采样服务。 （一）仪器指标： ①　服务商许自主拥有性能不低于*** ******** ******** **单细胞标记建库平台。 ②　服务商需自主拥有性能不低于******** ******* **** 高通量测序平台，支持*****测序模式，且至少**%的碱基质量分值高于***。 （二）组织解离及细胞活性要求 ①　细胞活性＞**%； ②　细胞总量＞******； ③　结团率＜*%； ④　细胞浓度范围在***~*********/μ* 之间。 （三）文库质量和数据产出要求： ①　文库质检合格后，每个转录组文库测序数据量大于****； ②　目标捕获细胞数*****个，浮动范围在**%以内； ③　细胞平均*****＞***； ④　细胞基因中位值≥****； ⑤　测序饱和度**%~**%； ⑥　测序数据基因组比对率≥**。