福建/福州-2026-04-17 00:00:00
我院拟委托一名供应商提供小鼠空间转录组检测服务。现将调研事宜公告如下,欢迎具有相关资质的单位前来递交调研文件。
一、采购要求和范围
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物种/样本来源 |
产品 |
数量 |
数据量 |
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小鼠 |
空间转录组 |
** |
***** |
样品检测合格后采取以下技术路线进行高精度空间转录组测序: 高精度空间转录组样品制备——组织优化――表达实验及文库构建——上机测序――生物信息学分析。
*.主要进行以下检测分析:
*.*分析条目
*.测序数据统计与评估
*)数据质控
*)数据定量
*)基因表达定量
*)****** *** 统计及最优 *** 策略选择
*)图像识别、配准、分割和 **** *** 统计
*.*** 聚类分析
*)低质量 *** 过滤
*)*** 聚类结果统计
*)各样本在各亚群 *** 数量统计
*)基因在各个 *** 亚群表达量均值统计
*)分群结果可视化
*.亚群上调基因分析
*)上调表达基因筛选
*)上调表达基因 ** 功能富集分析
*)上调表达基因 **** 功能富集分析
*)上调表达基因 ** 功能富集分析(仅限人)*)上调表达基因 ******** 功能富集分析(仅限人、大鼠、小鼠)
*.亚群特征基因分析
*)亚群特征基因筛选
*)亚群特征基因表达分布
*)亚群特征基因蛋白质互作网络分析
*.*在线报告分析
*.**** 分组方案
*.基因集筛选
*)聚类基因集筛选
*)目标基因集筛选
*.**** 亚群分类分析
*)**** 频率分析
*)组织映射图(亚群信息、转录本(***)信息)
*)分类 **** 图(亚群信息、样本信息、转录本(***)信息)
*)分类 **** 图(亚群信息、样本信息、转录本(***)信息)
*.基因分布查看
*)组织映射图(表达量、分类)
*)基因 **** 图(表达量、分类)
*)基因 **** 图(表达量、分类)
*)基因小提琴图
*)基因气泡图
*)基因热图
*.亚群上调基因分析
*)亚群上调统计柱状图
*)亚群上调基因分布
*)上调差异基因 ** 富集
*)上调差异基因 **** 富集
*.空间通讯分析(仅限人、小鼠)
*)细胞互作分析
*)配受体对分析
*.组间差异分析
*)差异基因统计
*)差异基因分布
*)差异基因 ** 富集
*)差异基因 **** 富集
*)**** 分析
*、各方工作内容及进度安排
*.* 供应商
*.供应商在收到院方样品及送样单后开始样品检测。
*.项目周期以样品检测合格后开始计算:** 个样本以内,周期为 ** 个工作
日,样本数每增加 ** 个,周期增加 * 个工作日;供应商需在项目周期内(五一、十 一等国家法定节假日不计入)完成全部测序及测序数据的处理工作。
*.若在测序或数据处理中遇到技术障碍,供应商应与院方及时沟通,双方沟
通时间应从本条第二点中的工作日中扣除。
*.若因样品送样单、样品关系单等需要院方提供的信息不及时发送或信息
有误所造成的耽误时间,应从上述第二点中的工作日中扣除。
*.如试验过程院方因实际需要而增加样本数量或检测数据量,经供应商确认
双方完成协议内容变更,技术服务费用按照实际的样本数量和检测数据量进行
计算。院方需按照供应商要求支付技术服务费差额,差额支付后,供应商将完整的数据和报告全部交给院方。如院方未按规定时间支付差额费用,供应商不承担因此导致的项目延期、成果交付迟延等责任。
*.对于检测不合格的样品,如需保存,院方应在收到样品检测报告后 * 天
内与供应商联系,并发送《返样单》。如院方逾期未与供应商联系或返样单不到
位,该不合格逾期样品会在样品检测报告发出后的 * 天后进行销毁。对于完成
测序分析,剩余样本需要返还的项目,院方需要在收到项目完整版结题报告 *
个月内提出,发送《返样单》,同时支付返样所需的干冰及快递费用。院方逾
期未与供应商联系或返样单不到位,样本将进行销毁。
*.供应商在向院方提供项目结果和报告后,原始测序数据保留数据的时间为
三个月。对于合同中涉及在线报告的项目,供应商将免费提供院方本合同中所涉及项目的在线报告 * 年使用权限(从项目结题报告交付开始计算),并约定续期方案如下:
*)在使用权限到期前 * 个月以内,供应商将向院方联系邮箱至少发送一次
在线报告使用权限到期提醒,提醒院方申请使用权限延期或者及 时备份个人数据。
*)院方如有延期需求,则须在使用权限到期前联系供应商,申请使用权限延期并支付相应费用。
*)院方如没有延期计划但有数据备份需求,则须在使用期限到期前联系供应商,
从账户中拷贝取回个人账户数据。
*)对于使用权限到期的项目,供应商将删除项目数据,不再提供数据保管服务。
*、成果交付
供应商在项目完成之后向院方邮箱发送结题报告并视为送达;院方在收到结
题报告后 ** 天内,如无反馈视为对本项目交付结果满意(院方邮箱以合同院方
指定邮箱为准,院方反馈邮箱以供应商发送结题报告的邮箱为准)。测序过程中
产生的序列文件*.** 和相关生物信息分析结果文件,可通过网络传输或院方自
行提供 * 盘或移动硬盘传输。供应商确保提交符合合同约定的数据量给院方。考虑到生物学实验的不确定性,即在各样本总数据量达标的情况下,每个样本数据量不低于目标数据量的 **%,平均 ***≥**%,平均 ***≥**%。如果实际测序产生的数据量超出合同约定的数据量,供应商将所有下机数据全部提交给院方,供应商提交给院方的信息分析结果将基于所有提交给院方的数据。
双方确定,按以下标准及方法对供应商完成的研究开发成果进行验收:对于
提供的基因组测序深度,测序数据质量,数据分析结果全部达到合同规定标准,并得到院方确认。
付款方式:
双方合同签订后,院方以对公转账的方式支付合同总金额**%给供应商,待所有服务完成后,经院方验收无误后,院方支付剩余**%款项。
二、调研文件要求
请按以下顺序装订材料并密封,每页加盖公章。
*、报价表;
*、营业执照复印件;
*、法定代表人授权委托书原件并加盖公章(供应商是法定代表人的无需提供);
*、法定代表人及投标代表的有效身份证复印件。
*、服务承诺
*、相关资质证明
三、市场调研接收材料时间
****年*月**日*****年*月**日*:*****:**,**:*****:**(周末及法定节假日除外)
四、报名要求:将纸质采购材料装订密封后递交至福建省福州市台江区八一七中路***号省人民医院*号楼二层后勤处办公室。
五、联系人:廖先生*************
六、本公告同时在福建中医药大学附属人民医院院内、院外网上发布。
福建中医药大学附属人民医院
****年*月**日



