结直肠癌代谢组学检测：申康示范性临床队列建设项目：上海市结直肠癌生物样本多组学数据库的建设

项目名称：肿瘤医院结直肠癌代谢组学检测：申康示范性临床队列建设项目：上海市结直肠癌生物样本多组学数据库的建设

项目预算：**万

项目需求：

本项目包括肿瘤医院***例组织样本靶向代谢组****;非靶向代谢组****;蛋白质组学检测及****例血浆样本的蛋白质组检测。需求如下：

一、靶向代谢组学服务范围

基于*****/**（液相色谱 * 串联质谱）技术平台及合规商品化试剂盒，对***种以上小分子代谢产物开展绝对定量检测与分析服务。

二、靶向代谢组学服务要求

*、代谢组学检测技术要求

*.*样本规格：血样：***;****；

*.*检测方法要求

*.*.*★需采用商品化试剂盒完成***种及以上小分子代谢产物检测，覆盖氨基酸、短链脂肪酸、中长链脂肪酸、酚类、吲哚、有机酸、胆汁酸、肉碱、糖类及碳水化合物等类别，检测体系包含至少**种同位素内标，提供完整内标检测证明；

*.*.*★提供检测方法的方法学验证数据，包括但不限于线性范围、检出限（***）、定量限（***）、精密度、准确度等关键指标。；

*、数据分析要求

*.*质控体系：需纳入标准品混合物、同位素内标、混合生物样本及空白样本四类质控样本，全程参与检测流程以保障数据可靠性。

*.*数据分析

*.*.*定量计算：采用内标法进行绝对定量，提供***种及以上小分子代谢产物的准确绝对浓度数据；

*.*.*★每种物质提供*点以上标准曲线，同位素内标数量不少于**个；

*.*.*★ 质控样本（**）的相对标准偏差***≤**% ，提供数据证明

*.*.*统计分析：提供主成分分析（***），偏最小二乘判别分析（******），正交偏最小二乘判别分析(*******)等多维及单维统计结果；

*.*.*提供差异代谢物筛选单维统计分析、多维统计结果，并能提供相应的箱线图、韦恩图、热图等；

*.*.*提供潜在生物标志物筛选分析结果，并具有相应的箱线图、小提琴图等；

*.*.*进行通路分析，提供****及**富集分析数据及图片；

*.*.*对潜在生物标志物进行诊断实验，包括随机森林（****** ******，**）、支持向量机（******* ****** *******，***）和******分析等；

*.*.*个性化分析：按需提供相关分析，多组学联合分析，建模分析及聚类分析服务；

*、项目验收要求

*.* 质控指标：质控样本（**）的相对标准偏差（***）≤**%

*.*定量结果：提供各组样本中检出代谢物的绝对浓度数据汇总表

*.*统计图表：提供 *** 得分图、****** 得分图、******* 得分图

*.* 通路分析：提供完整的 **** 及 ** 富集分析数据与可视化图

*.* 报告完整性：验收资料需包含检测原始数据、分析过程说明、统计结果、可视化图表及完整分析报告。

三、非靶向代谢组学服务要求

*、代谢组学检测技术要求

*.*检测平台：****** ******** ******** ***质谱仪。

*.*数据库：*万+代谢物和***万+谱图的数据库（自建库+公共库）

*.*质谱参数：*****色谱分离后的***源条件如下：雾化气辅助加热气 （****）：**，辅助加热气*（****）：**，气帘气（***）：**，离子源温度：***℃，喷雾电压（****）±**** *（正负两种模式）；一级质荷比检测范围：******* **，二级质荷比检测范围：******* **，一级质谱扫描累积时间：*.** */*******, 二级质谱扫描累积时间：*.** */*******；二级质谱采用*********** ********* *********** （***）获得，并且采用 **** *********** 模式，去簇电压（**）：±** *（正负两种模式），碰撞能量 ：**±** **，*** 设置如下：动态排除同位素离子范围：* **，每次扫描采集**个碎片图谱。

*.*数据处理：采用****程序进行峰对齐、保留时间校正和提取峰面积。对****提取得到的数据首先进行代谢物结构鉴定、数据预处理（空值过滤：删除缺失值＞**%的离子峰；空值填充：*** 填充：数据过滤：过滤 ******;**%的*******）。 *.*分析内容：鉴定结果与统计分析（代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计）；组间差异分析（单变量统计分析、多维统计分析）；差异代谢物生物信息学分析（差异数倍分析、韦恩分析、丰度分析、层次聚类分析、相关性分析、****分析、*****分析、****分析、***分析）；其它分析（*****分析、临床指标关联分析、集成机器学习分析）和质控分析（**样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析、**样本相关性、总体样本*********‘* **检验、**样本的多变量控制图、**样本的相对标准偏差）。

四、蛋白组学服务范围

*、蛋白组学检测技术要求

*.*检测平台：超高压液相色谱*质谱联用仪******** ****** **** ************（****** **********）平台。

*.*仪器参数：***分析采用纳升流速 ******** ***系统(赛默飞)进行色谱分离，纳升级高效液相色谱分离后的样品用使用********** ******** **** ************上机检测，单次上机检测时长为** ***。检测模式：正离子，母离子扫描范围为 ********/*，一级质谱分辨率为 ****** ** *** */*，********** *** ****** 为***%，******* ** 为 ***。*** 采用 *** 数据采集模式，设置***个扫描窗口，********* ******为**/*，*** ********* ******为****，********** *** ******为***%，******* ** 为 ***。数据库检索鉴定到的蛋白必须通过设定的过滤参数 ******;*%。；实时监测项目进度，包括从送样到核样、领样、实验、到数据分析，至发送报告，每一步有迹可循，做到随时跟踪，及时反馈；********定量，质控样本蛋白含量是否满足实验需求，等量进行后续实验保证定量检测的准确性；********结果，质控每例样本蛋白完整性。

*.*分析软件：采用****** *.*.*软件进行数据检索，搜库参数的阈值为默认值。

*.*分析内容：鉴定数量统计（统计表格、***、****、皮尔森相关性分析、***分析和蛋白丰度分析）；表达差异分析（统计表格、火山图、箱线图、聚类分析、雷达分析）；差异蛋白功能注释（亚细胞定位、结构域分析、**功能、****通路分析、********通路分析、************通路分析、****分析等）；其他生信分析（转录因子分析、激酶分析、互作网络分析、*****分析）、***实验**及样本质控（平均半峰宽分析、肽段长度分析、******* ***分析、**样本**分布、**样本***分布、**样本相关性、样本定量强度分布、组间样本定量强度分布、内标***保留时间分析）。

五、项目周期

自收到采购人提交的样品后**个工作日内完成全部检测、数据分析及报告交付工作。

六、其他需求

*、人员配备：具有生物医药等相关专业背景或资格证书。

*、有针对本项目的管理制度、监管安全措施等。

*、针对安全突发事件提供应急响应，提供****小时电话，远程响应和现场支持。

*、有相关培训方案或实施计划。

*、有相关业绩优先。

技术参数联系人：李老师 ***********

参与本项目论证报名联系：赵老师 ******** ****

备注：有意向单位，于****年**月*日**:**之前，将单位名称、联系人姓名、电话、参与的论证项目名称等报名信息，发至此邮箱*********@**.***

采购需求调查表*上海市结直肠癌生物样本多组学数据库的建设服务.****