品目*:病原体特征实验数据前处理器
一、用途
用于病原体特征实验数据的管理,以及病原微生物基因组数据分析,包括病毒、细菌、真菌、支原体/衣原体等微生物的快速鉴定、分型溯源及基因组学研究,通过细菌核心基因组构建系统进化树,可视化分型特征、重点基因特征、时空分布特征和传播特征,自动匹配样本信息综合管理病原体特征实验数据。不限制测序平台,二代、三代测序数据均可自动化分析(包括但不限于***、********、********、******),全中文操作系统。
二、技术参数
★*.分析软件均提供图形操作界面,无需任何代码编写及参数设置,通过任意选中目标测序数据,点击一个按钮即可完成分析;分析软件兼容性需满足至少二代测序,三代测序平台产生的数据进行分析,支持单样本、多样本测序数据自动化导入分析。
*.具备进行病原菌、病毒的菌毒株基因组测序全流程分析,宏基因组的组装、分箱分析,基于*****的未知病原识别的模块或相关功能。
*.病原菌分析模块(或相关功能)
*.*.提供细菌数据管理及分析流程,支持从原始测序数据开始,一键完成数据质控、基因组拼接、物种鉴定、血清型分型、****分型、******分型、 ***分析、耐药与毒力基因组注释、移动元件分析及相关耐药毒力基因注释,并根据样品及病原学鉴定结果进行物种溯源,生成可视化监测和预警图形。(提供体现对应内容的操作界面截图)
*.*.病原参比数据库要求***种以上物种,****分型支持***种以上物种;******分型体系支持不少于***种物种(*******)并正式发表,血清型覆盖不少于沙门氏菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、肺炎链球菌、副溶血性弧菌、霍乱弧菌、志贺菌、猪链球菌、流感嗜血杆菌*个物种(*******)。
*.*.支持多组数据同时进行******、***分析时自动构建系统发育进化树,包含至少*种树图可视化方式;进化树图支持自定义可视化显示的内容,以及相关样式的修改,并且能够直接查看进化树上各数据之间的差异基因矩阵,并导出图谱及统计数据;支持***种以上高质量*****公共数据库,自动完成本地序列与公共序列的相似性比对,以及进化树分析。
*.*.细菌物种鉴定参考基因组与国家致病菌识别网相同,能批量导出.****格式的批量样本加密文件以及.****格式的基因组序列加密文件,文件可直接上传到国家致病菌识别网监测网络中。(提供体现对应内容的操作界面截图)
*.宏基因组分析模块(或相关功能)
能实现一步对宏基因组测序数据质控、物种分类、宏基因组序列组装、序列分箱、序列注释(对**、****、*********、***、*******、****等数据库进行功能注释);可对***、***、***扩增子测序数据的单样本物种分类,以及多组样本进行微生物多样性和差异化分析。可同时检测≥*****种物种信息条目,信息条目不少于病毒(*万*千种)、细菌及古菌(*万*千)、真菌(*万种)、原虫(*千种)。(提供体现对应内容的操作界面截图)
*.未知病原分析模块(或相关功能)
可以进行未知病原分析鉴定功能,能够排除非感染相关微生物及定植菌,分析结果以细菌、真菌、***病毒、***病毒、其他病毒、寄生虫进行物种分类,并计算出每个属相对丰度、序列数,以及每个种的序列数、相对丰度、基因组覆盖度,可根据人间感染名录及不同的感染部位,在报告中报出相应的可疑致病微生物;同时基于至少两个数据库注释出耐药基因,至少一个数据库注释出毒力基因;以上分析结果可直接导出*****及****格式报告;将样本信息与病原微生物检出结果结合,自动化统计不同症候群中病原检出率、抗生素检出率、耐药基因变异频率,并自动化识别高危病原物种,可视化图谱包括地图、树图、饼图、桑基图、热图等。(提供体现对应内容的操作界面截图)。
*.病毒分析模块(或相关功能)
支持病毒数据从原始测序数据开始,一步完成测序数据质量控制、基因组数据组装拼接、***分析、基因功能注释,并支持不少于 *****种(*******)病毒分析,以及*****种亚种分析;至少*种功能数据库,包括****、*******、******、********、*******、****;根据分析结果及样本等信息自动化生成可视化监测和预警图形。内置以上每种病毒的高质量公共数据库,可在本地服务器完成*****比对分析,并构建系统发育进化树。(提供体现对应内容的操作界面截图)。
*.测序数据样本信息集中管理模块(或相关功能)
支持所有病原体测序数据样本信息的集中管理,涵盖样本录入、编辑与删除操作,支持单独查看单个病原体及所有病原体的样本信息。对样本的原始数据、分析报告、结果文件分别进行存档,便于数据的选择性清理;支持测序数据的批量上传,并可与样本信息自动关联;支持所有主流测序仪的下机数据及其压缩格式,自动识别测序策略,并自动生成序列编号;提供多条件筛选功能,支持批量导出样本信息。支持科研项目及课题管理,记录样本衍生数据。(提供体现对应内容的操作界面截图)
*.具备数据的实时监测功能,病原菌、未知病原等病原分析数据可对应地区,从空间、时间方面对不同谱系进行可视化追踪;分析数据同时支持中国地图、省份地图、市级地图可视化方式显示各地区序列数量的实时监测,及各地区排名数据列表;显示可选时间范围内各地区序列数量和亚型构成比;显示各地区序列数量和谱系随时间动态构成比。(提供体现对应内容的操作界面截图)
★*.每个分析模块或系统要求都要有样本数据管理模块,要求支持样本数据的统一维护,包括样本相关基本信息的录入、编辑、删除,并且支持批量样本导入;支持基因组文件的批量导入,包含原始下机数据及组装基因组文件,不限测序平台类型,并与样本信息自动化建立关联关系;根据不同模块筛选条件,批量导出样本基本数据及分析结果信息。(提供体现对应内容的操作界面截图)
**.病原体特征实验数据前处理分析服务器配置不低于***:*****(*.**/***/***/***/****)、内存:****** **** **** ******* ****、存储:***.****企业级固态硬盘/****
三、配置
*.病原体特征实验数据前处理分析服务器 一台
*.细菌数据管理及基因组全流程分析系统(或模块) 一套
*.宏基因组多样性和差异化分析系统(或模块) 一套
*.未知病原分析与监测系统(****)(或模块) 一套
*.病毒基因组分析与监测系统(或模块) 一套
*.病原体测序数据样本信息集中管理系统(或模块) 一套
品目*:多聚酶链式反应扩增仪
一、用途
用于基因扩增过程中的定性***和基因测序过程中的文库构建。
二、技术参数
*.模块规格:配备*.******铝合金模块,且具备更换模块功能,支持至少*.******模块、***模块、原位模块和平板模块
★*.有效孔位:**孔(单管,*连管,**连管,无裙板,半裙板)
*.温度准确度:≦±*.*℃
*.模块控温精度:≦±*.*℃
*.模块温度均匀性:≦±*.*℃ @**℃
*.最大升温速率:≥*℃/*
*.最大降温速率:≥*℃/*
*.模块控温技术:不少于*路*******独立控温+分布式模块温度补偿
*.模块温度控制模式:管子(试剂**设置)/ 模块
★**.模块温度设置范围不小于:*****℃
**.热盖温度设置范围不小于:******℃,**/***(热盖可开启和关闭)
**.具有智能热盖设置功能,可根据程序自动设定热盖温度
★**.温度梯度功能/范围/跨度:不少于**列梯度/*****℃/****℃,只需设置最左、最右列温度,其他列温度自动计算赋予
**.具有升降温速率设定功能,不少于*.***.*℃/*范围可调,等速率变温
**.具有最近运行文件列表
**.具有***接口,用户文件一键导入/导出,台间程序交换便捷;*盘软件升级
**.显示屏:不小于*寸触摸屏
**.运行状态显示,包括但不限于动态温色背景、动画运行状态、呼吸灯指示、蜂鸣提示
**.多种界面可切换,包括但不限于简单主界面、程序运行界面、动态曲线界面、工程界面
**.具有智能抑制非特异性扩增功能,程序运行等待热盖恒温过程中模块可满足**℃恒温
**.具有智能试剂温度控制功能,根据设定的反应体系容量进行精准控温
**.压盖自适应试管,试管高度自适应(高管、矮管、平顶管、圆顶管等全适应)
**.具有梯度温度同时到达功能
**.具有开机智能自检功能
**.具有故障自诊断及报告功能
**.具有运行结束冷藏功能,最低可设定*℃冷藏温度
**.具有总时间/剩余时间预估功能,并图像化显示
**.具有制冷片寿命预警功能
**.具有屏幕触摸点校准功能。
三、配置
多聚酶链式反应扩增仪 一台
品目*:压力蒸汽灭菌器
一、用途
设备利用饱和压力蒸汽对物品进行迅速而可靠的消毒灭菌,用于培养基制备过程中的灭菌处理,及感染性废弃物灭菌处理
二、技术参数
*.容量:≥**升,立式结构,底部带脚轮;腔体直径≥****,可放入直径****,高度****的灭菌架
★*.灭菌腔材料:*******不锈钢,设计使用年限≥**年
*.开关盖方式:触拨式开关,垂直向上打开腔门
*.时间范围要求如下:不少于灭菌时间:******分钟;融化时间:******分钟;保温时间:******分钟;定时器预置范围:****天延迟
★*.温度和压力: 最高工作温度≥***℃,设计温度≥***℃,灭菌温度*******℃,融化温度******℃,保温温度*****℃,设计压力≥*.*****,安全阀起跳压力≥*.*****
★*.干烧保护装置:灭菌腔底同时配备不少于液胀式、铜质温度感应式、离子浓度式(水位传感器)三种不同干烧保护装置
*.记忆存储系统:可记忆存储≥**条灭菌程序
*.排汽方式:灭菌结束完成后,排气阀可按设定大于等于六级排汽速度排汽,同时在排气过程中排汽速度可随时进行手动调整。
*.彩色液晶触摸屏:≥*英寸彩色液晶触摸屏,彩色(五种以上颜色)液晶显示灭菌器各种状态,戴上厚手套或用笔也可操作灭菌器
**.集汽瓶:内置双蒸汽集汽瓶,不会影响周围环境,前置集汽瓶,方便使用
★**.权限管理:具有五级或者五级以上密码操作权限。
**.标配冷却风扇,灭菌结束可快速降低腔体温度
★**.水质检测系统:具有水质检测功能,当灭菌腔水质脏污时机器可以自动进行提醒换水。
**.腔门完全敞开及任意停留性能:腔门完全打开与灭菌腔达到**度角,大件样品可垂直从腔内取出;且腔盖可以在任意角度停留,防止腔盖突然砸下风险,人性化操作台面结构:地面到操作台面的高度不超过****
**.冷却锁开盖温度:根据灭菌物品热惯性的不同,客户可设置不同灭菌物品开盖的温度,只有温度降到设定的温度才能打开腔盖
★**.数据追溯功能:控制系统存储器可存储不少于***次灭菌进程记录,并可查询及打印方便追溯管理
**.***存储接口:标配***数据存储接口,可实时导出灭菌过程的各项数据,方便进行灭菌数据分析
**.饱和蒸汽监测:系统自动监测冷空气排放情况,确保纯蒸汽的灭菌环境
**.检验接口:提供温度、压力校验接口,方便进行校验,可搭配**验证转接头,最多可同时接入不少于**根温度探头
**.预设灭菌模式:包含但不限于液体、液体带保温、固体、废弃物、琼脂,以及针对特殊物质灭菌器的自定义灭菌模式
**.仪器的操作需要简便人性化:压力表前置,废水壶前置,打印机口前置。
**.安全装置:具备电动式双内锁,超温保护系统、干烧保护系统、过压双重保护、安全阀、过流、短路保护系统、冷却锁,漏电保护装置、防烫腔盖和台面、自动故障检测系统,后台安全测试等安全措施
三、配置
*.压力蒸汽灭菌器 一台
*.符合压力蒸汽灭菌器使用的不锈钢提篮 两个
*.冷却风扇 一套
*.设备证件 一套
*.符合压力蒸汽灭菌器使用的备用压力表 一套
*.符合压力蒸汽灭菌器使用的备用安全阀 一套
品目*:样本研磨仪
一、用途
用于海产品甲肝检测前的样本冷冻研磨处理,快速均一化处理海产品消化腺,以便于后续检测等。
二、技术参数
*.采用**破碎,冷冻一体化技术,对生物样本进行预处理
★*.控温范围不小于:*℃***℃,内置制冷和加热恒温系统,适于***提取,无需额外的液氮冷却和辅助加热设备
*.配备可更换的**×***、**×***、*×****样本适配器,以满足不同样本量粉碎需求
★*.破碎速度:满足***.**/*范围可调,步进调速设定:≤*.***/*;具有长片段基因组***提取连续低转速运行功能
*.设备内置操作系统,无需额外电脑连接,不低于*.*英寸彩色触摸屏
★*.单次最长破碎时间:≥**分**秒,循环数≥**次
*.具有电磁锁定设计保证运行安全
*.整体不锈钢内腔设计,易清洁、防污染
★*.噪音:≤****
**.具有卡扣压盖固定结构,可快速固定和开启样品
**.可设置保存不少于**个程序,满足不同样本的粉碎需求
三、配置
*.样本研磨仪 一台
*.开机测试和培训必要的耗材(不少于**个测试) 一套
注:需求内容与招标文件不一致的,以招标文件内容为准