600例人重全基因组测序(30X)(FS-BX-250100号)采购公告
2025-11-03
广东/深圳 招标采购
600例人重全基因组测序(30X)(FS-BX-250100号)采购公告
广东/深圳-2025-11-03 00:00:00
项目名称 ***例人重全基因组测序(***) 项目编号 ************号
公示开始日期 ********** **:**:** 公示截止日期 ********** **:**:**
采购单位 深圳医学科学院 付款方式 验收合格后支付***%
联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求 成交后**个自然日(如不按时签订合同,采购单位有权取消或变更采购结果) 到货时间要求
预算 ***,***
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

; 供应商基本情况表 (必选)

收货地址
采购清单*
采购物品 采购数量 计量单位 所属分类
***例人重全基因组测序(***) *** 基础医学研究服务
品牌
规格型号
技术参数 *. 服务范围
受委托单位须依据委托单位提供的样本(白细胞),完成 *** 提取、建库及全基因组测序。提供服务的实验室须持有 *** 等国际认证机构颁发的有效资质认证。
*. 样本与 *** 质控
*.* 受委托单位须对提取的 *** 样本进行质量控制,并根据质量进行分级。
*.* 须向委托单位提交 *** 质量检测报告,详述质控结果。
*. 测序数据要求
*.* 每个样本的原始测序数据量须不低于 ** **(以核苷酸数计)。
*.* 在样本提取合格的前提下,测序数据须满足以下质量指标:
*) *** 碱基比例 ≥ **%
*) *** 碱基比例 ≥ **%
*) 数据冗余度(*********** 率)***; **%
*. 数据质控与重处理
*.* 若样本测序后出现以下情况之一,且原样品有剩余,受委托单位须对指定样本进行免费重提取:
*) 原始数据量未达到 ** **;
*) 发现样本存在污染或降解。
*.* 若重提取后 *** 质量仍不合格,委托单位可提供备份样品,受委托单位进行提取、建库与测序,并另行收取相应费用。
*.* 因生物信息学质控或样本不合格导致的样本重测,将根据实际使用的服务环节(提取、建库、测序)按约定价格收费,未使用的环节不收费。
*.* 因生物信息学质控不合格导致的单纯加测(仅需补测序),受委托单位须免费执行。
*. 设备与数据安全
*.* 测序服务须使用我国拥有自主知识产权的测序平台。
*.* 自项目启动至项目完成后三个月内,相关测序设备须与互联网物理隔离或保持断网状态。
*. 数据交付与存储
*.* 数据交付须按委托单位指定的方式进行。
*.* 受委托单位须在数据交付后,为委托单位保留数据副本 ** 天。如委托单位对数据有疑问,须在 ** 天内提出重新拷贝申请。
*.* 项目完成后,剩余的生物样本须返还委托单位。
*.* 受委托单位须根据委托单位的书面要求,彻底删除所有人类遗传资源数据(包括但不限于白细胞、*** 样本、测序数据等),不得以任何形式隐匿或保留。
*. 保密与责任
*.* 受委托单位有义务保障人类遗传资源数据安全,严禁向任何非协议相关方泄露。
*.* 未经委托单位书面同意,受委托单位不得将本项目的任何部分分包或转包给第三方。如有违反,视为根本违约,委托单位有权追究其法律责任并要求赔偿损失。
*. 知识产权与后续支持
*.* 本项目所产生的所有测序数据及相关知识产权,归委托单位所有。
*.* 项目进行中或结束后,如委托单位在论文发表、课题申请中需要技术材料,受委托单位有义务提供必要的配合与撰写支持。
*. 生物信息学分析流程
受委托单位须按照 **** 标准流程对每个样本的 ***** 文件进行处理,生成可用于联合变异检测(***** *******)的 **** 文件,并完成以下分析与交付:
*.* 数据预处理:去除接头序列和低质量数据,并提供每个样本的 ***、*** 数据。
*.* 序列比对与覆盖度分析:使用 *** 软件将序列比对至 **** 参考基因组,并提供以下指标:
*) 每个样本的全基因组、常染色体组、* 染色体、* 染色体的平均测序深度;
*) 全基因组范围测序深度达到 **×、*×、*×的覆盖比例(需排除重复序列和未定位/随机染色体区域)。
*.* 提供每个样本的比对率(******* ****)、错配率(******** ****)、** 含量及重复序列率。
*.* 提供联合变异检测后生成的 *、* 染色体 *** 文件(包含 *** 和 *****),供委托单位进行质控与样本筛选。
**. 群体遗传学质控评估样本是否存在人源污染、微生物污染,并分析个体间亲缘关系,形成专项报告。
**. 最终变异检测与数据交付
**.* 委托单位在获取上述数据并进行样本筛选后,将指定最终样本列表与分析参数,受委托单位须据此完成联合变异检测(含 **** 步骤)。
**.* 最终交付物须包括:
*) 每个样本的 ***** 压缩文件、*** 文件、**** 压缩文件(含 *** 和 *****),以及 ****前、后的 *** 压缩文件(含 *** 和 *****)。
*) 详细的质量控制参数与完整分析流程文档。
*) 每个样本的所有数据须独立存放于以样本名命名的文件夹中。
*) 提供所有交付文件的 *** 校验码。
**.* 委托单位在接收数据时,将出具书面接收证明。
售后服务


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