智慧育种数据分析平台[长城慧采云]
2025-08-07
河北/保定 变更澄清
智慧育种数据分析平台[长城慧采云]
河北/保定-2025-08-07 00:00:00
河北/保定-2025-08-07 00:00:00
智慧育种数据分析平台
寻源单号:**************
报名联系人:魏华
发布时间:********** **:**:**
报名联系电话(优先联系):***********
公示截止时间:********** **:**:**
办公电话:***********
项目所在地:河北省保定市
品类:育种软件系统开发
距离报名截止还剩:
寻源内容
项目概况与招标范围
*.项目概况:我司育种数据已形成了表型数据+基因组数据的完整数据库,数据规模呈几何级数增加,且当前开展的基因组
育种测定数据分析、计算基因组育种值,需借助第三方检测平台实现,存在数据安全风险。
根据育种系统架构规划设计,现阶段已满足大数据分析的条件,故申请对智慧育种系统升级,搭建育种数
据分析平台,建设自己的育种数据分析能力。
*.项目所在地:保定市易县
*.开票要求:增值税普通发票
育种测定数据分析、计算基因组育种值,需借助第三方检测平台实现,存在数据安全风险。
根据育种系统架构规划设计,现阶段已满足大数据分析的条件,故申请对智慧育种系统升级,搭建育种数
据分析平台,建设自己的育种数据分析能力。
*.项目所在地:保定市易县
*.开票要求:增值税普通发票
投标主体报名要求
一、技术要求
*.软件需求
*.*亲缘系数计算
①集合不少于两种不同算法工具用于计算个体间亲缘关系系数、近交系数,以及各类可收集表型性状的遗传力、遗传相关、重复力等遗传参数。各类遗传参数应一一对应到相应个体,支持导出*****表,连续多世代可形成相关系数每个世代的变化趋势图进行前端展示。包含但不限于**** ** **. **** 、*** ***** ****以及亲缘关系推断软件****的***********分析成对的亲缘系数;
②个体间亲缘关系矩阵:通过二维表形式表现个体间的亲缘关系远近,支持***** 下载,支持用负值表示亲缘关系远近,矩阵中的数值应准确反映个体间的亲缘程度。
③亲缘关系热图:支持对某个区域进行放大查阅,使用户能够清晰查看热图中特定区域的细节信息;
④系数分布图:支持对系数进行图标(包含但不限于柱状图)形式展示,直观展示群体中亲缘关系系数的分布情况;
*.*系谱纠偏工具
①基于孟德尔遗传定律理论,利用高密度遗传标记对系谱进行纠偏;
②用户输入任务名称、数据集、系谱文件,系统应提供清晰的输入界面和格式说明,设置阈值,系统默认阈值范围为 *.****.**,用户可根据实际情况进行调整,调整过程应便捷直观;
③孟德尔错误率计算:包括子代和亲本,分别计算任意两两个体间的孟德尔错误率,根据频率分布的界限来确定阈值;
④系谱纠偏结果表:结果表按校正后系谱、校正说明、原始系谱、校正后父母本孟德尔错误率及个数等字段进行展示;
⑤系谱纠偏统计结果表:含总系谱个数(=子代个数)、无法纠偏系谱个数(=子代没有基因型的个体数)、正确系谱个数、错误系谱个数、系谱错误率(错误系谱个数/(错误系谱个数+正确系谱个数)、错误系谱个数/总的系谱个数)等字段;
⑥清晰显示校正前后的系谱信息对比,包括错误位置和校正内容;
⑦孟德尔错误率分布图:支持按父本、母本柱状图显示;
*.*育种自动化分析
*.*.*育种值计算
①基于全基因组选择方法,对育种群体进行育种值的计算,从而筛选出优秀个体及提高遗传进展,功能包括参考群、候选群群体的管理以及育种值结果的可视化;
②通过选择物种,支持比较关注的最少*个重要性状在首页面进行数据化展示;
③保存后再次打开即可展示*个重要性状的数据详情,满足对全部、已激活、未激活等个体的展示;
④可通过排序过滤或自定义对育种结果详情进行查看;
⑤对选育目标对育种值进行标准化转化(选育目标由我们进行设计与修改)
⑥可进行综合育种计算(每种性状可由我们进行编辑)
⑦除基因组育种值计算外,也包含传统育种值计算方法,如搭载*****、*****等计算模型;
*.*.*自动化分析
①育种辅助分析工具,支持可视化绘制、遗传进展、选种选配等功能;
②育种数据主面板支持按场区、笼号、翅号、性别、品种、出生日期等字段进行显示,字段支持可配置;
③支持结果导出,当参考群体发生变化时,个体育种值相应发生变化,默认显示最新版本结果;
④可根据不同性状权重生成自定义综合选择指数;
⑤可视化绘制、遗传进展功能支持文件、图片格式下载;
*.*选种选配
①新建分析:选择单个或多个的公鸡、母鸡进行选种选配分析,输出结果公鸡、母鸡交配后代对应性状的预测成绩及父母本育种值;
②支持在线筛选、文件筛选(支持模板下载)两种方式公/母鸡;
③在线筛选可按笼号、翅号、出生日期范围选种公/母鸡;
④可视化:根据字段显示,字段可配置;
*.*育种模型:
*.*.*基因组及芯片基本信息
①育种芯片***位点信息:包含笼号、翅号、染色体名称、***坐标、***碱基、***碱基等字段;
②性状优势相关碱基型:支持查看详情、下载功能,
*.*.*系谱信息管理
①核心材料:新建核心材料,包括核心材料编号(自动生成)、导入状态(成功/失败)、***缺失数量、***缺失率、纯合位点数、纯合位点比例、杂合位点数、杂合位点比例等信息;
②表型和系谱:支持用户通过上传品种、表型等表单文件,建立基础的文件和信息数据库;
*:表型数据:支持字段自定义、表型管理、查看和统计功能;
*:系谱数据:支持系谱管理、样本搜索、家系***信息、计算近交系数;
*:分析工具:至少包含其中一种分析工具,***分析、聚类分析、*****;
③基因型数据:二维表形式展示,支持导入***、***格式文件;
*.*.* **/****分析
①育种模型:
包含但不限于:回归模型、随机森林模型、神经网络模型、*****模型、******模型、***** *模型、***** *模型、***** ***模型、机器学习和*******等方法;支持基因芯片检测结果***文件上传,开展****分析,获得该性状的关键候选位点,并计算*******育种值;
②育种报告:
*:样本信息:
*:***信息:
*:关联***位点的纯化率:
*:育种模型预测结果:包含但不限于回归模型、神经网络、随机森林、*****、 ***** * 、***** *、***** ***、******预测结果的数据显示,支持表格下载;
③****分析:具备全基因组关联分析 (****) 能力,挖掘与性状相关的遗传标记,为育种改良提供依据。
*.*可视化:
前端可视化,针对每个栋舍、品系或其他需求能够自动进行群体数据分析,形成可视化图表;
*.*系统集成:
①单点登录:集成我司自开发工作台*兴芮******,实现单点登录;
②对接***、育种系统、实验室管理系统,接口应采用标准的数据交换格式和协议;
③系统***接口永久免费开放,后期接入其他信息系统时不得另行收取接口费用;
*.*亲缘系数计算
①集合不少于两种不同算法工具用于计算个体间亲缘关系系数、近交系数,以及各类可收集表型性状的遗传力、遗传相关、重复力等遗传参数。各类遗传参数应一一对应到相应个体,支持导出*****表,连续多世代可形成相关系数每个世代的变化趋势图进行前端展示。包含但不限于**** ** **. **** 、*** ***** ****以及亲缘关系推断软件****的***********分析成对的亲缘系数;
②个体间亲缘关系矩阵:通过二维表形式表现个体间的亲缘关系远近,支持***** 下载,支持用负值表示亲缘关系远近,矩阵中的数值应准确反映个体间的亲缘程度。
③亲缘关系热图:支持对某个区域进行放大查阅,使用户能够清晰查看热图中特定区域的细节信息;
④系数分布图:支持对系数进行图标(包含但不限于柱状图)形式展示,直观展示群体中亲缘关系系数的分布情况;
*.*系谱纠偏工具
①基于孟德尔遗传定律理论,利用高密度遗传标记对系谱进行纠偏;
②用户输入任务名称、数据集、系谱文件,系统应提供清晰的输入界面和格式说明,设置阈值,系统默认阈值范围为 *.****.**,用户可根据实际情况进行调整,调整过程应便捷直观;
③孟德尔错误率计算:包括子代和亲本,分别计算任意两两个体间的孟德尔错误率,根据频率分布的界限来确定阈值;
④系谱纠偏结果表:结果表按校正后系谱、校正说明、原始系谱、校正后父母本孟德尔错误率及个数等字段进行展示;
⑤系谱纠偏统计结果表:含总系谱个数(=子代个数)、无法纠偏系谱个数(=子代没有基因型的个体数)、正确系谱个数、错误系谱个数、系谱错误率(错误系谱个数/(错误系谱个数+正确系谱个数)、错误系谱个数/总的系谱个数)等字段;
⑥清晰显示校正前后的系谱信息对比,包括错误位置和校正内容;
⑦孟德尔错误率分布图:支持按父本、母本柱状图显示;
*.*育种自动化分析
*.*.*育种值计算
①基于全基因组选择方法,对育种群体进行育种值的计算,从而筛选出优秀个体及提高遗传进展,功能包括参考群、候选群群体的管理以及育种值结果的可视化;
②通过选择物种,支持比较关注的最少*个重要性状在首页面进行数据化展示;
③保存后再次打开即可展示*个重要性状的数据详情,满足对全部、已激活、未激活等个体的展示;
④可通过排序过滤或自定义对育种结果详情进行查看;
⑤对选育目标对育种值进行标准化转化(选育目标由我们进行设计与修改)
⑥可进行综合育种计算(每种性状可由我们进行编辑)
⑦除基因组育种值计算外,也包含传统育种值计算方法,如搭载*****、*****等计算模型;
*.*.*自动化分析
①育种辅助分析工具,支持可视化绘制、遗传进展、选种选配等功能;
②育种数据主面板支持按场区、笼号、翅号、性别、品种、出生日期等字段进行显示,字段支持可配置;
③支持结果导出,当参考群体发生变化时,个体育种值相应发生变化,默认显示最新版本结果;
④可根据不同性状权重生成自定义综合选择指数;
⑤可视化绘制、遗传进展功能支持文件、图片格式下载;
*.*选种选配
①新建分析:选择单个或多个的公鸡、母鸡进行选种选配分析,输出结果公鸡、母鸡交配后代对应性状的预测成绩及父母本育种值;
②支持在线筛选、文件筛选(支持模板下载)两种方式公/母鸡;
③在线筛选可按笼号、翅号、出生日期范围选种公/母鸡;
④可视化:根据字段显示,字段可配置;
*.*育种模型:
*.*.*基因组及芯片基本信息
①育种芯片***位点信息:包含笼号、翅号、染色体名称、***坐标、***碱基、***碱基等字段;
②性状优势相关碱基型:支持查看详情、下载功能,
*.*.*系谱信息管理
①核心材料:新建核心材料,包括核心材料编号(自动生成)、导入状态(成功/失败)、***缺失数量、***缺失率、纯合位点数、纯合位点比例、杂合位点数、杂合位点比例等信息;
②表型和系谱:支持用户通过上传品种、表型等表单文件,建立基础的文件和信息数据库;
*:表型数据:支持字段自定义、表型管理、查看和统计功能;
*:系谱数据:支持系谱管理、样本搜索、家系***信息、计算近交系数;
*:分析工具:至少包含其中一种分析工具,***分析、聚类分析、*****;
③基因型数据:二维表形式展示,支持导入***、***格式文件;
*.*.* **/****分析
①育种模型:
包含但不限于:回归模型、随机森林模型、神经网络模型、*****模型、******模型、***** *模型、***** *模型、***** ***模型、机器学习和*******等方法;支持基因芯片检测结果***文件上传,开展****分析,获得该性状的关键候选位点,并计算*******育种值;
②育种报告:
*:样本信息:
*:***信息:
*:关联***位点的纯化率:
*:育种模型预测结果:包含但不限于回归模型、神经网络、随机森林、*****、 ***** * 、***** *、***** ***、******预测结果的数据显示,支持表格下载;
③****分析:具备全基因组关联分析 (****) 能力,挖掘与性状相关的遗传标记,为育种改良提供依据。
*.*可视化:
前端可视化,针对每个栋舍、品系或其他需求能够自动进行群体数据分析,形成可视化图表;
*.*系统集成:
①单点登录:集成我司自开发工作台*兴芮******,实现单点登录;
②对接***、育种系统、实验室管理系统,接口应采用标准的数据交换格式和协议;
③系统***接口永久免费开放,后期接入其他信息系统时不得另行收取接口费用;
二、投标主体资质要求
注册资金:≥*** 万元;
经营范围:生物技术服务、技术开发、技术咨询、技术交流、技术转让、技术推广;牲
畜销售;农、林、牧、副、渔业专业机械的销售;电子产品销售;
投标方应具有成熟的系统解决方案,必须在建议书中详细陈述其在类似服务领域技术创
新和实施的能力,阐述对于本实施项目的特点的理解以及适用的技术和方法论。
经营范围:生物技术服务、技术开发、技术咨询、技术交流、技术转让、技术推广;牲
畜销售;农、林、牧、副、渔业专业机械的销售;电子产品销售;
投标方应具有成熟的系统解决方案,必须在建议书中详细陈述其在类似服务领域技术创
新和实施的能力,阐述对于本实施项目的特点的理解以及适用的技术和方法论。
三、投标主体业绩要求
① 投标方提供近 * 年的主要业绩(包含:项目名称、合同首页和尾页);
② * 个以上同规模农牧行业成功解决方案;
② * 个以上同规模农牧行业成功解决方案;
四、报名方式
*.凡有意参加报名的供应商,请至长城慧采云平台注册报名:地址为:*****://***.***.**,注册成功后可根据项目名称,按报名要求进行报名,此方式为唯一报名途径;
*.如无法在招标平台完成注册的,请及时联系报名联系人。
*.如对本项目有技术疑问或想了解更多详细信息,可将问题分条描述清晰,发送至(****@******.***)。邮件中请注明公司名称、联系人及联系电话;
*.邮件主题须注明项目名称、报名联系人,如**项目疑问**收,将统一进行答疑回复。
发布媒体
本次信息发布只在长城慧采云平台网页上发布,其他媒体转载无效。如遇信息调整最终以长城慧采云平台公示报名内容为准。
争议解决
投标方和招标人在采购过程中所引起的争议,双方应通过友好协商解决,协商不成时,任何一方均应向采购方所在地人民法院提起诉讼。
注:无论报名结果如何,供应商自行承担所有与参加报名活动有关的全部费用。
集团举报渠道
邮箱:*********@***.***(集团纪检组) ****@***.***(董事长办)
**:**********(集团纪检组) 微信:*********(集团纪检组)
手机/短信:***********(秘密特工组)
电话:************(集团纪检组) ************(董事长办)
通信地址:河北省保定市朝阳南大街****号董事长办公室/监察审计部
邮编:******
兴芮举报途径:
电话:************
**:**********
邮箱:******@******.***
通讯地址:河北省保定市徐水区兴芮温泉度假区
兴芮快捷酒店**楼(监察审计部)




