***** 第三代基因测序仪(数量:*套、进口);
★一、功能需求
对生物样本进行核酸分析,无需***过程,直接对***/***进行序列分析,分析过程可同时检测核酸修饰。适应于现场人员、动植物、细菌、病毒等生物样本。应用范围:全基因组测序、靶向测序、*** 测序、宏基因组测序、表型研究等。样本类型包括人类基因组、动植物基因组、微生物基因组以及各种临床标本的 *** 和 ***;
二、主要技术参数
*.第三代纳米孔测序仪主机
*.* 单分子测序: ***/**** 直接测序,无需 *** 扩增,免除 *** 扩增带来的错误和 ** 偏差;直接对样品进行检测,无需荧光标记;
★*.*长读长:可读取提取核酸的全长,最长可读取****;
*.* 测序起始量:从**级到**级都可以进行建库;
*.* 建库时间:配合快速建库试剂盒使用,可以在**分钟之内完成文库的制备;
*.* 运行时间:* *** * ** *;
★*.* 直接 *** 测序:提取***无需转换成****即可进行测序;
*.* 碱基修饰:甲基化检测:碱基修饰基于电信号的差异检测碱基,在 ***/**** 测序同时可直接检测碱基修饰;
*.* 速度:***测序速度最高可达***碱基每秒,***测序最高可达**碱基每秒;
*.* 实时数据输出:核酸上机后大于等于 ****即可产生实时数据,便于监控核酸及建库质量,并可以实时序列比对;
*.** 准确度:读取**次目标***序列中的每一个碱基,测序准确度可达**.*%;
*.** 使用成本:配合清洗试剂盒,纳米孔芯片可以多次使用;
★*.** 纳米孔芯片数据产量:单张芯片实际产出为****数据量;
*.**清洗试剂盒可用于测序芯片的清洗和再利用。
*.分析服务器
*.* 分析服务器硬件参数:***数量≥*;***数量≥*;***主频≥*.****,核心数≥*核,线程数≥**;***显卡内存≥***;****核心≥****;显示器:≥ **英寸;分辨率:≥**** * ****;内存:≥***,固态硬盘≥******;企业级机械硬盘容量≥***;
★*.* 乌班图操作系统:基于*****内核的开源操作系统,支持***、******、***等多种架构。
*.核酸荧光定量计
*.* 可定量 *****、*****、*** 或蛋白质的浓度。
*.磁力架
*.* 用于对包括细胞在内的小分子进行温和的管式分离和纯化。
*.系统软件
*.*序列比对系统:测序得到的读长与参考基因组进行比对,从而确定读长在基因组中的位置和方向。
★*.* 测序数据较正系统:对原始数据进行处理和优化,提高数据的准确性的功能
*.* 变异分析系统:识别样本基因组与参考基因组之间的差异,包括单核苷酸变异(****)、插入/缺失(******)、结构变异(***)和拷贝数变异(****)
*.*修饰分析系统:检测和分析***或***分子上的化学修饰(如甲基化、羟甲基化等),可检测***、****、***等
*.*宏基因组分析系统:复杂微生物群落中的所有基因组进行测序和分析,以揭示微生物的多样性、功能和相互作用。宏基因组分析无需分离培养单个微生物,直接对环境样本(如土壤、水体、肠道等)中的***进行测序。
★三、配置清单:配置清单中内容为必须满足项,不参与打分,不得负偏离,否则投标无效。
*.第三代纳米孔测序仪主机*台
*.分析服务器*台(乌班图操作系统);
*.核酸荧光定量计*台;
*.磁力架*个;
*.系统软件(序列比对系统、测序数据较正系统、变异分析系统、修饰分析系统、宏基因组分析系统)
*.配套试剂和耗材:测序芯片*张(原厂)、清洗试剂盒*盒(原厂)、连接测序试剂盒*盒(原厂)、三代测序***多样本辅助建库试剂盒*盒(通用)、样品纯化磁珠*** *盒(通用),核酸荧光定量计耗材*盒(通用)